HISEQ2000,illumina高通量测序
HISEQ2000,illumina高通量测序
1、测序不是按碱基算的，而是按反应的算得，现在在上海这边一般在25-30元之间一个反应，一个反应保证有效读数在800个碱基。如果基因组测序现在多是采用的二代测序技术，这样的平摊到每个碱基上的钱更少了。
illumina高通量测序介绍如下：原理 illumina的Hiseq2000和454都是通过单序列的扩增放大信号，只是Hiseq2000中间有桥式扩增，可以两头测序。
b）单 端 测 序 Single-read sequencing（SR，单端测序）只检测基因片段一段的基因信息。c）混 样 测 序 Index Sequencing：将多种样本混合测序 充分利用solexa高通量测序特点。
Illumina的这种测序技术每次只添加一个dNTP的特点能够很好的地解决同聚物长度的准确测量问题 (Homopolymer错误)，它的主要测序错误来源是碱基的替换，目前它的测序错误率在1%-5%之间。
不过到2005年以后，高通量测序就改指第二代测序（Next generation sequencing），45Solexa(后改为Illumina）和SOLiD等第二代测序，比3730等第一代测序的通量提高了成千上万倍，甚至上亿倍，所以称为高通量测序。
另一个就是2006年美国Illumina公司推出的Solexa基因组分析平台（Genome Analyzer platform），为此，2007年ABI公司推出了自主研发的SOLiD 测序仪(ABI SOLiD sequencer)。
1、宏基因组测序原理将基因组DNA随机打断成若干条500bp的小片段（类似于拼图中的单个形状不一的模块），然后连接接头（双端120bp），在片段两端加通用引物进行PCR扩增测序。
2、以典型的二代测序平台Illumina为例，其测序原理是基于桥式聚合酶链式反应（PCR）的边合成边测序，特点是读长短、准确性高。和一代测序相比，具有测序速度快、准确性高以及成本低的优良特性。
3、宏基因组学研究不要求对每个微生物进行分离纯化培养，而是直接从样品中提取基因组DNA后进行测序分析。
4、宏基因组测序则是将微生物基因组DNA随机打断成500bp的小片段，然后在片段两端加入通用引物进行PCR扩增测序，再通过组装的方式，将小片段拼接成较长的序列。16S测序主要研究群落的物种组成、物种间的进化关系以及群落的多样性。
1、Illumina公司的Solexa测序平台，目前主流的型号的HiSeq-2500，以及Hiseq-2000，数据通量在每张Flow cell 300G数据，每次最多可以上2张Flow cell，单张Flow cell运行时间大约在11天左右。
2、交流起来方便）。一般好点的研究所都有的。还有就是，根据你的研究课题来选什么机器测序（比如454，illumina等）。我知道上海有蛮多的：康成生物、上芯（伯豪）、众信等公司。上海血研所，同济大学、复旦医学院都有的。
3、mgi平台是超高通量测序。MGI展示了新平台DNBSeqTx其中x代表极限吞吐量，并显示了一些有限的性能数据，据负责人介绍，该平台是致力于实现基因组学全覆盖并使其打破限制且负担得起。
4、Solexa高通量测序平台均可对转录组进行测序，由于两种平台各有其优缺点，针对不同的样品情况，需灵活选用。
5、目前常说的高通量测序是指用第二代测序技术来进行测序 第三代测序技术（单分子测下），读长较长，错误率较高，成本较高。
6、测序方案建立在双脱氧测序法(Sanger等，1977)的基础上。为了从每一克隆插入片段两端成对地进行测序，每一个质粒模板DNA板应配备两个384孔循环测序反应板。
